RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 A8MVJ9 347 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 RRHO14718 337 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCP110O43303 1012 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CA12O43570 354 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX2O60749 519 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFRSF8P28908 595 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNJ4P48050 445 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 JAK3P52333 1124 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC12A2P55011 1212 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTA1Q13330 715 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTGR1Q14914 329 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC44A5Q8NCS7 719 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRGUKQ96M69 825 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOMER2Q9NSB8 354 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 FZD4Q9ULV1 537 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa3.4□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 H3BML4 177 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGPSO00116 658 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB27BO00194 218 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 UGDHO60701 494 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF2O60811 474 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPN2O95208 641 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF2P09038 288 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPA6P17066 643 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NTSR1P30989 418 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 GALNSP34059 522 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 P2RX3P56373 397 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 FHL3Q13643 280 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF7Q14155 803 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NFATC4Q14934 902 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDXDC1Q6P996 788 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFX6Q8HWS3 928 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MED30Q96HR3 178 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 KAZALD1Q96I82 304 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SELENONQ9NZV5 590 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PPC1 479 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM225BP0DP42 221 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST6GAL1P15907 406 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS6KB1P23443 525 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLRC1P26715 233 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC29A2Q14542 456 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 UEVLDQ8IX04 471 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL31RAQ8NI17 732 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCAS4Q8TDM0 211 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAML1Q92585 1016 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEUROG1Q92886 237 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOOK2Q96ED9 719 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUCLG2Q96I99 432 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 NMRK2Q9NPI5 230 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHA12Q9UN75 941 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACOT8O14734 319 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBX3O15119 743 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKAP10O43572 662 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAS8-AS1O95177 125 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYBP10242 640 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPH1P17752 444 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARRB2P32121 409 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms