RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 PRAMEF12O95522 483 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 RARGP13631 454 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ASPAP45381 313 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 KDSRQ06136 332 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ERICH1Q86X53 443 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMG2Q969U7 264 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ASB3Q9Y575 518 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CILPO75339 1184 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 VDRP11473 427 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SKILP12757 684 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PON1P27169 355 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SMARCB1Q12824 385 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 UNC93AQ86WB7 457 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 DENND1CQ8IV53 801 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 S1PR5Q9H228 398 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.86□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 DNA2P51530 1060 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 BCAT1P54687 386 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC39CQ8N584 583 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CACNA1EQ15878 2313 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 LTBP2Q14767 1821 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR23AA6NEV1 266 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 AKR1B10O60218 316 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TACC1O75410 805 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 MICAL2O94851 1124 aa6.85□□□□□ -1.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 ZBED1O96006 694 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CYBBP04839 570 aa6.85□□□□□ -1.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 UCHL3P15374 230 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 DESP17661 470 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 RAD23BP54727 409 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPRNQ16849 979 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ACCSLQ4AC99 568 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C4orf46Q504U0 113 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TMC6Q7Z403 805 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 VPS36Q86VN1 386 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA20Q8TB22 786 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TFAP2BQ92481 460 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 BBS2Q9BXC9 721 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.85□□□□□ -1.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 INVSQ9Y283 1065 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.85□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM221A6NGB7 291 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 M0R296 226 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SRGAP2O75044 1071 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 BPIFB4P59827 614 aa6.84□□□□□ -1.31
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RRN3P1-201ENST00000514813 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 MTF1Q14872 753 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 PON2Q15165 354 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 UBR7Q8N806 425 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 SHDQ96IW2 340 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR88Q9GZN0 384 aa6.84□□□□□ -1.31
RRN3P1-201ENST00000514813 GDE1Q9NZC3 331 aa6.84□□□□□ -1.31
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