RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506024.5

PDE4D-214, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-214ENST00000506024 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 ZNF577Q9BSK1 485 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 VPS45Q9NRW7 570 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 AKAP13Q12802 2813 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 FREM2Q5SZK8 3169 aa4.6□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 ARL5CA6NH57 179 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 C4orf47A7E2U8 309 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 FAM86B1E9PN63 330 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 CAPNS1P04632 268 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 RHOP08100 348 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 NCAM1P13591 858 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 CEACAM1P13688 526 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 RXRAP19793 462 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 FCARP24071 287 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 CCNE1P24864 410 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 GDI1P31150 447 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 HOXA6P31267 233 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 MC3RP41968 323 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 DNM2P50570 870 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 NAPAP54920 295 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 PSMD5Q16401 504 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 UGCGQ16739 394 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 TMEM151BQ8IW70 566 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 HASPINQ8TF76 798 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 TSPAN17Q96FV3 270 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 MSANTD3Q96H12 275 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 PWWP2AQ96N64 755 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 GAD1Q99259 594 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 MAP3K14Q99558 947 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 GPR27Q9NS67 375 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 SNTG2Q9NY99 539 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 KLK13Q9UKR3 277 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 IPPQ9Y573 584 aa4.59□□□□□ -1.67
PDE4D-214ENST00000506024 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 LNP1A1A4G5 178 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 WDR27A2RRH5 827 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 TMEM150BA6NC51 233 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 H7BY64 318 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 HIP1O00291 1037 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 SGSM2O43147 1006 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 ADAM12O43184 909 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 CHMP2AO43633 222 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 AKAP3O75969 853 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 ERLIN2O94905 339 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 HOXC13P31276 330 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 ANTXR2P58335 489 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 GRIK3Q13003 919 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 SERINC3Q13530 473 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 TESK1Q15569 626 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 ELF2Q15723 593 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 VMACQ2NL98 169 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 PRR16Q569H4 304 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 UBXN11Q5T124 520 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.58□□□□□ -1.68
PDE4D-214ENST00000506024 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.58□□□□□ -1.68
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