RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 STBD1O95210 358 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TIMP1P01033 207 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 OR52Z1P0C646 297 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 THPOP40225 353 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 NRG3P56975 720 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 PRKCEQ02156 737 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 RESTQ13127 1097 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TPH2Q8IWU9 490 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TET1Q8NFU7 2136 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 LPPQ93052 612 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 FAM20AQ96MK3 541 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 CLIC4Q9Y696 253 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 EMSYQ7Z589 1322 aa8.25□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 SLITRK3O94933 977 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 IQCF3P0C7M6 154 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 CKBP12277 381 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 KLRC1P26715 233 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 JAK3P52333 1124 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 NPEPPSP55786 919 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 KRT85P78386 507 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ADAM17P78536 824 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 PPP2R5CQ13362 524 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 GPNMBQ14956 572 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 SHHQ15465 462 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TCTN1Q2MV58 587 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 CT83Q5H943 113 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 MFSD5Q6N075 450 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 SESTD1Q86VW0 696 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 METTL13Q8N6R0 699 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 PLIN2Q99541 437 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 GDF15Q99988 308 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 POLD4Q9HCU8 107 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 GINS2Q9Y248 185 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.24□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TBX3O15119 743 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 HBP1O60381 514 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 NBNO60934 754 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 MED24O75448 989 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 FSBPO95073 299 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 PDCP20941 246 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 SFNP31947 248 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 CSF2RBP32927 897 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TRAPPC10P48553 1259 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 CLCN3P51790 818 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 FPGSQ05932 587 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 DRP2Q13474 957 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 SPECC1Q5M775 1068 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF365Q70YC5 407 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 ANO5Q75V66 913 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 SERINC5Q86VE9 423 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 GAB3Q8WWW8 586 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 WDR92Q96MX6 357 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 LXNQ9BS40 222 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 PRSS50Q9UI38 385 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 USP18Q9UMW8 372 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 NRCAMQ92823 1304 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.23□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 GRXCR1A8MXD5 290 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 GABRDO14764 452 aa8.22□□□□□ -1.09
UBE2B-204ENST00000504431 DAPK3O43293 454 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms