RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 PPP3CCP48454 512 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 RAB6CQ53S08 254 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ODF2Q5BJF6 829 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 KRT35Q92764 455 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CD101Q93033 1021 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 NT5C3BQ969T7 300 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CORO1BQ9BR76 489 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SNX12Q9UMY4 172 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.99■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 GREB1Q4ZG55 1949 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PSTPIP1O43586 416 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TCF4P15884 667 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CTNNA2P26232 953 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 HOXA9P31269 272 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CXCR5P32302 372 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 HDAC4P56524 1084 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 NACA2Q9H009 215 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 F9P00740 461 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 KRT7P08729 469 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 RNF34Q969K3 372 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ASAH2Q9NR71 780 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TLR5O60602 858 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 MYL4P12829 197 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TCP1P17987 556 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 GABRR2P28476 465 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 MARCKSL1P49006 195 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 RWDD2BP57060 319 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 EFEMP1Q12805 493 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 HECTD3Q5T447 861 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TAC4Q86UU9 113 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 FAM131BQ86XD5 332 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CASP10Q92851 521 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 GCNAQ96QF7 691 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM265A0A087WTH1 108 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SRGAP2O75044 1071 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TBX18O95935 607 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PTPN2P17706 415 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC38Q5VT99 294 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PIDD1Q9HB75 910 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 PIGVQ9NUD9 493 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 MYO9BQ13459 2157 aa22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PSPC1-204ENST00000492741 ENDOD1O94919 500 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 F11P03951 625 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 IL1R2P27930 398 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 HSPH1Q92598 858 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 ALG3Q92685 438 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 SERPINB11Q96P15 392 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.95■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 MDM4O15151 490 aa22.94■■□□□ 1.26
PSPC1-204ENST00000492741 PRLRP16471 622 aa22.94■■□□□ 1.26
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