RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	USP18	Q9UMW8	372 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292		F8W8V4	182 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMC3	P17980	439 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	PRKCE	Q02156	737 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	ANO4	Q32M45	955 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF786	Q8N393	782 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	CERK	Q8TCT0	537 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNK13	Q9HB14	408 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	CDH22	Q9UJ99	828 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292		V9GYQ6	96 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR27	A2RRH5	827 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BSA7	217 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	FDFT1	P37268	417 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	JAK3	P52333	1124 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	GMCL1	Q96IK5	515 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	APOL2	Q9BQE5	337 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF358	Q9NW07	568 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	POLI	Q9UNA4	740 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	POMP	Q9Y244	141 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	APOL1	O14791	398 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SIN3B	O75182	1162 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SERPINA6	P08185	405 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MCF2	P10911	925 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CASP2	P42575	452 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMD7	P51665	324 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KRT76	Q01546	638 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PAK5	Q9P286	719 aa		10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLIT2	O94813	1529 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	AKAP10	O43572	662 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PSAP	P07602	524 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	AVPR1A	P37288	418 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MLH1	P40692	756 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TLK1	Q9UKI8	766 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMCO1	Q9UM00	188 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP8B3	O60423	1300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TPP1	O14773	563 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	GRIN3B	O60391	1043 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	USP12	O75317	370 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	HMGCR	P04035	888 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CSH1	P0DML2	217 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CSH2	P0DML3	217 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	IL1R2	P27930	398 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	EPHA3	P29320	983 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NFIL3	Q16649	462 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC14	Q49A88	953 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	IFNE	Q86WN2	208 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.14	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms