RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 CD72P21854 359 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 FANCCQ00597 558 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 BEND5Q7L4P6 421 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 PASD1Q8IV76 773 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 TTC8Q8TAM2 541 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 DCLK3Q9C098 648 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 MYO6Q9UM54 1294 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.46■■□□□ 1.03
NOM1-208ENST00000489850 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 SHISA7A6NL88 538 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 MDM4O15151 490 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 SOX9P48436 509 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 NR1I3Q14994 352 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 SYNCQ9H7C4 482 aa21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 PI15O43692 258 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 TPM3P06753 285 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 GJA4P35212 333 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 UBASH3AP57075 661 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 LRRC32Q14392 662 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 EDEM1Q92611 657 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CLDN23Q96B33 292 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 PLD4Q96BZ4 506 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CPXM1Q96SM3 734 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 IER2Q9BTL4 223 aa21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 STC2O76061 302 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 GLI1P08151 1106 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 COL9A1P20849 921 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CDR2Q01850 454 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 DHCR24Q15392 516 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 TAF3Q5VWG9 929 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 ASNSD1Q9NWL6 643 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.43■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 SLC12A8A0AV02 714 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CAPN9O14815 690 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 GREM1O60565 184 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CYP17A1P05093 508 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 NCAM1P13591 858 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 IQCDQ96DY2 449 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 NUP58Q9BVL2 599 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.42■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 HSF2BPO75031 334 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 MMEP08473 750 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 ADH5P11766 374 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 FERP16591 822 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 CHKAP35790 457 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 ZNF445P59923 1031 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 GAD2Q05329 585 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 PON2Q15165 354 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 FIGNQ5HY92 759 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 Q6ZNB5 142 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.41■■□□□ 1.02
NOM1-208ENST00000489850 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms