RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 UBR7Q8N806 425 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 NRG4Q8WWG1 115 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 STAMQ92783 540 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 CATSPER2Q96P56 530 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 SIKE1Q9BRV8 207 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 COQ4Q9Y3A0 265 aa8□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TCP11X1B4DZS4 312 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 CCDC188H7C350 402 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 OGTO15294 1046 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 EXTL3O43909 919 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 FTCDO95954 541 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 CDK4P11802 303 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 GRIA2P42262 883 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 MAP7Q14244 749 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 PSMD6Q15008 389 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 MIIPQ5JXC2 388 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TTC8Q8TAM2 541 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 POM121Q96HA1 1249 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TMEM109Q9BVC6 243 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 H0Y3Z8 333 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 BIRC5O15392 142 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 SLC34A2O95436 690 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 LYNP07948 512 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 GALK1P51570 392 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 SP4Q02446 784 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 UPP1Q16831 310 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TTI2Q6NXR4 508 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 KLC3Q6P597 504 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 NLRP7Q8WX94 980 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 OLFM3Q96PB7 478 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 ADAM2Q99965 735 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 ZBP1Q9H171 429 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 ANKRD63C9JTQ0 380 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 ASMTLO95671 621 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 SYN1P17600 705 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 LAG3P18627 525 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 FGFR3P22607 806 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 ARFIP2P53365 341 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.99□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.99□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.98□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 ARL5CA6NH57 179 aa7.98□□□□□ -1.13
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USP4-211ENST00000485450 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 BMPR1AP36894 532 aa7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 ZNF132P52740 706 aa7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 PEX3P56589 373 aa7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 E2F2Q14209 437 aa7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 NAT14Q8WUY8 206 aa7.98□□□□□ -1.13
USP4-211ENST00000485450 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
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