RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SMOC1Q9H4F8 434 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PLK2Q9NYY3 685 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DNMT3LQ9UJW3 386 aa13.68□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TBC1D3BA6NDS4 549 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 APBB3O95704 486 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GRIA2P42262 883 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 WASP42768 502 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PLA2G4AP47712 749 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TKTL1P51854 596 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 EFEMP1Q12805 493 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 KCNH2Q12809 1159 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CRY1Q16526 586 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SGO2Q562F6 1265 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CCDC183Q5T5S1 534 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ANO7Q6IWH7 933 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TMEM270Q6UE05 265 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZNB5 142 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TRIM59Q8IWR1 403 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 FRMD1Q8N878 549 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GPT2Q8TD30 523 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 OTUB2Q96DC9 234 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 BBS2Q9BXC9 721 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 UBXN6Q9BZV1 441 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RXFP3Q9NSD7 469 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SEMA4GQ9NTN9 838 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DLL3Q9NYJ7 618 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RASAL2Q9UJF2 1139 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 O00370 1275 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TYRP14679 529 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TNFRSF4P43489 277 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RGS7P49802 495 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PAK1Q13153 545 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PLK5Q496M5 336 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PKDCCQ504Y2 493 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 BTBD8Q5XKL5 378 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PM20D1Q6GTS8 502 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 KLHDC10Q6PID8 442 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TTC39CQ8N584 583 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 EHBP1Q8NDI1 1231 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 MDGA1Q8NFP4 955 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 TSTD1Q8NFU3 115 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RLN3Q8WXF3 142 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 EDEM1Q92611 657 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ACDQ96AP0 544 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 KREMEN1Q96MU8 473 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 NT5C1BQ96P26 610 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ACOX2Q99424 681 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CLIC5Q9NZA1 410 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DEC1Q9P2X7 70 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 EBF1Q9UH73 591 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.66□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DCDC2BA2VCK2 349 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 YJEFN3A6XGL0 299 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PRRT4C9JH25 899 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 E7ENQ6 273 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PMM2O15305 246 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GNA14O95837 355 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ZBED1O96006 694 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CISD3P0C7P0 127 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 RALAP11233 206 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 VDRP11473 427 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 LCP1P13796 627 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 BCKDHBP21953 392 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PSEN1P49768 467 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 APBA1Q02410 837 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ADIGQ0VDE8 80 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 PMF1Q6P1K2 205 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 GJB7Q6PEY0 223 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ZNF276Q8N554 614 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DNAI2Q9GZS0 605 aa13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
HPS1-211ENST00000478087 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms