RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 DRGXA6NNA5 263 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 AGAP14A8MT82 685 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGES3LE9PB15 166 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS4O75173 837 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNDBP1O95273 360 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CSF1RP07333 972 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CLTBP09497 229 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 WEE2P0C1S8 567 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 GCSHP23434 173 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 MGAT1P26572 445 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 UBA7P41226 1012 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 GSTM5P46439 218 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CHN2P52757 468 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 31.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PTP4A2Q12974 167 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 DCTN1Q14203 1278 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 E2F2Q14209 437 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 RASA2Q15283 850 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 TBCCQ15814 346 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP28Q4G0W2 176 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 FEM1CQ96JP0 617 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGSQ96S52 555 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PNKPQ96T60 521 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP72Q9P209 647 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 SUFUQ9UMX1 484 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF711Q9Y462 761 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 VILLO15195 856 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKCHP24723 683 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 GPD2P43304 727 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGGTB-209ENST00000473406 ACOX1Q15067 660 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 VSIG1Q86XK7 387 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 SGPP1Q9BX95 441 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 NTMQ9P121 344 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 STK17AQ9UEE5 414 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 RCE1Q9Y256 329 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR47O94967 919 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PGM3O95394 542 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 TNNT1P13805 278 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 GNAT2P19087 354 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 DRD1P21728 446 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ADORA2AP29274 412 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 TM4SF1P30408 202 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ACSL1P33121 698 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 NNMTP40261 264 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 GSK3AP49840 483 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 MTHFSP49914 203 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE6CP51160 858 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 EPS8Q12929 822 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 HECTD3Q5T447 861 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-209ENST00000473406 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.6□□□□□ -1.35
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