RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471895.1

FBXO44-208, Transcript of F-box protein 44, human

TSL 3

Gene FBXO44, Length 769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO44-208	ENST00000471895	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895		A0A1W2PQC6	194 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	GREM1	O60565	184 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	LTF	P02788	710 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	HMBS	P08397	361 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	GJA4	P35212	333 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	COG7	P83436	770 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	AMPD2	Q01433	879 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NR1H3	Q13133	447 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NR1I3	Q14994	352 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	PON2	Q15165	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NCAM2	O15394	837 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	STC2	O76061	302 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CYP17A1	P05093	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	FYN	P06241	537 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	MME	P08473	750 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NUBP1	P53384	320 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	UBASH3A	P57075	661 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	ARID5A	Q03989	594 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	FZD5	Q13467	585 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	DHCR24	Q15392	516 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	ZNF677	Q86XU0	584 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	FAM170A	A1A519	330 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	ADH1C	P00326	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	KLKB1	P03952	638 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	ERBB2	P04626	1255 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CHRNB1	P11230	501 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NCAM1	P13591	858 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CHRNB2	P17787	502 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	GALK1	P51570	392 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	SNX16	P57768	344 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CDR2	Q01850	454 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895		Q6ZNB5	142 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	BEND5	Q7L4P6	421 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	TMEM25	Q86YD3	366 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	BAP1	Q92560	729 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	PLD4	Q96BZ4	506 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	DCLK3	Q9C098	648 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	CAPN9	O14815	690 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	ADH5	P11766	374 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	MAGEA9	P43362	315 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	NOMO3	P69849	1222 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	FMO1	Q01740	532 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	TAF5	Q15542	800 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	GAB4	Q2WGN9	574 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FBXO44-208	ENST00000471895	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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