RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466606.1

EDEM3-205, Transcript of ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3, human

TSL 3

Gene EDEM3, Length 487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDEM3-205	ENST00000466606	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	REPS1	Q96D71	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SNX2	O60749	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	FGF18	O76093	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CREB1	P16220	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	EP400	Q96L91	3159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	ABCA8	O94911	1581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TJP3	O95049	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	FGA	P02671	866 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	AR	P10275	920 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	GABRB3	P28472	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MCM5	P33992	734 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	HSPA7	P48741	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	COPA	P53621	1224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PROK1	P58294	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	GPS1	Q13098	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	GJA10	Q969M2	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PODXL	O00592	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	CA12	O43570	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	COQ9	O75208	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	JTB	O76095	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RBL1	P28749	1068 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	HTR7	P34969	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	SOX10	P56693	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	LMAN2	Q12907	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EDEM3-205	ENST00000466606	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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