RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442860.5

CCDC18-AS1-213, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 358 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SCAPQ12770 1279 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 LLGL1Q15334 1064 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 TCTN1Q2MV58 587 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 USP41Q3LFD5 358 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 CFAP58Q5T655 872 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ALS2CLQ60I27 953 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PM20D1Q6GTS8 502 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 FAM131BQ86XD5 332 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 NUP93Q8N1F7 819 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 FAM71BQ8TC56 605 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ACTL9Q8TC94 416 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 RNF139Q8WU17 664 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 P3H4Q92791 437 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 NT5C3BQ969T7 300 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 FAF2Q96CS3 445 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 TMEM169Q96HH4 297 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 RNF157Q96PX1 679 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 TMEM209Q96SK2 561 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 KCNK16Q96T55 309 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PCDH9Q9HC56 1237 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 AAASQ9NRG9 546 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ABCC13Q9NSE7 274 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 COMMD8Q9NX08 183 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 DDIT4Q9NX09 232 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 USP3Q9Y6I4 520 aa7.32□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 VWA8A3KMH1 1905 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SGK1O00141 431 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SMAPO00193 183 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 OPA1O60313 960 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 KRT14P02533 472 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 URODP06132 367 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 CD48P09326 243 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 CYP2F1P24903 491 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 HTR7P34969 479 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ACTN2P35609 894 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ADCY8P40145 1251 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PSEN1P49768 467 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 NDUFV1P49821 464 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PLTPP55058 493 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 NME3Q13232 169 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 GPR17Q13304 367 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 MTA1Q13330 715 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SLMAPQ14BN4 828 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 NOMO1Q15155 1222 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PSMD5Q16401 504 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 C4orf22Q6V702 233 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 BNIPLQ7Z465 357 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 PCGF5Q86SE9 256 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 ALLCQ8N6M5 410 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 RNF34Q969K3 372 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 TOP1MTQ969P6 601 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 IGSF21Q96ID5 467 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SPATA17Q96L03 361 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SERPINB11Q96P15 392 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 YME1L1Q96TA2 773 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 EPAS1Q99814 870 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-213ENST00000442860 SMOC2Q9H3U7 446 aa7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms