RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 MFN2O95140 757 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 IRF1P10914 325 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PRIM2P49643 509 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 F8W810 466 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 OPLAHO14841 1288 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 BOLA3Q53S33 107 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 IER5Q5VY09 327 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 C4orf22Q6V702 233 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KYQ8NBH2 561 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 HPDLQ96IR7 371 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FOPNLQ96NB1 174 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM24O15164 1050 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PIDD1Q9HB75 910 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0U1RQJ8 604 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TCF3P15923 654 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ATP4AP20648 1035 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CYP2R1Q6VVX0 501 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MSH4O15457 936 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TRAPPC3O43617 180 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 GSSP48637 474 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TERB1Q8NA31 727 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SEMA4DQ92854 862 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 M0QYT0 321 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CPT1AP50416 773 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 C21orf59P57076 290 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 EMC1Q8N766 993 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SYT17Q9BSW7 474 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ITGA9Q13797 1035 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MTFR1Q15390 333 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TLR10Q9BXR5 811 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 DYRK4Q9NR20 520 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PEX1O43933 1283 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 RPS6KA5O75582 802 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CYP2C8P10632 490 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC1A6P48664 564 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 CSHL1Q14406 222 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 IRGCQ6NXR0 463 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 MROH8Q9H579 483 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 HEATR9A2RTY3 570 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ASNA1O43681 348 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 AKAP3O75969 853 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SSTR1P30872 391 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SHMT1P34896 483 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 ETAA1Q9NY74 926 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRU-204ENST00000428026 AK9Q5TCS8 1911 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 VWA5AO00534 786 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CENPAP49450 140 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 PGS1Q32NB8 556 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRU-204ENST00000428026 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms