RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.29■□□□□ 0.84
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC63Q05C16 580 aa20.28■□□□□ 0.84
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 NUP93Q8N1F7 819 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.27■□□□□ 0.84
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TRAPPC3-204ENST00000373166 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 HLA-DRAP01903 254 aa20.27■□□□□ 0.84
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TRAPPC3-204ENST00000373166 HECTD3Q5T447 861 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.27■□□□□ 0.84
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TRAPPC3-204ENST00000373166 COCHO43405 550 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF217O75362 1048 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NTSR1P30989 418 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM193AP78312 1265 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANO4Q32M45 955 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ISM2Q6H9L7 571 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SDE2Q6IQ49 451 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TERB1Q8NA31 727 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXO32Q969P5 355 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NME7Q9Y5B8 376 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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TRAPPC3-204ENST00000373166 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD59P13987 128 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 GTF2H1P32780 548 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP3CAQ08209 521 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC14A1Q13336 389 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 PROSER1Q86XN7 944 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM25Q86YD3 366 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.24■□□□□ 0.83
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TRAPPC3-204ENST00000373166 BIN1O00499 593 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 CLDN5O00501 218 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 WASP42768 502 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 MXI1P50539 228 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT39Q6A163 491 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNIP3Q96KP6 325 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP8B3O60423 1300 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAF4O00268 1085 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAMA5O15230 3695 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC3-204ENST00000373166 TUBP50607 506 aa20.23■□□□□ 0.83
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