RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM63Q969Q1 353 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 UROC1Q96N76 676 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMS19Q96T76 1030 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RTKNQ9BST9 563 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCED1AQ9H1Q7 454 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLK1Q9UKI8 766 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHHO43323 396 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNPH1O43598 174 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIP5K1CO60331 668 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACTL6BO94805 426 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE8BO95263 885 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGAP02671 866 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA6P08133 673 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM163BP0C2L3 166 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPD1P21695 349 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROZP22891 400 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLRK1P26718 216 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DIO1P49895 249 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNA2D1P54289 1103 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLE2P56282 527 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSG6Q00889 435 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 BFSP2Q13515 415 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FHL3Q13643 280 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 EID2BQ96D98 161 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCLT1Q96NL6 688 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CIPCQ9C0C6 399 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFU1Q9UMS0 254 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMRT1Q9Y5R6 373 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CA12O43570 354 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOC3O60645 756 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAF5LO75529 589 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GYS1P13807 737 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOX10P56693 466 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TGFB2P61812 414 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AP2B1P63010 937 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP4F2P78329 520 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEUP1Q05D60 604 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMAN2Q12907 356 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEMA3BQ13214 749 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBFBQ13951 182 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRM4Q14833 912 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TIGD6Q17RP2 521 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTBD16Q32M84 506 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCE1DQ5T752 114 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEP85Q6P2H3 762 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCSK4Q6UW60 755 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 OLFML1Q6UWY5 402 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RFX8Q6ZV50 586 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TERB1Q8NA31 727 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms