RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ENDOD1O94919 500 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 LSAMPQ13449 338 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 TUBB3Q13509 450 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 GRM2Q14416 872 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 FAM182AQ5T1J6 154 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 FAXCQ5TGI0 409 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ZPBP2Q6X784 338 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 FAM83AQ86UY5 434 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SEPT12Q8IYM1 358 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RTP4Q96DX8 246 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PEBP4Q96S96 227 aa19■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 HMX2A2RU54 273 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SERPINB9P50453 376 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RABGAP1LQ5R372 815 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 LPCAT4Q643R3 524 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RNF111Q6ZNA4 994 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 GSDMBQ8TAX9 411 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MIS12Q9H081 205 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RIPK3Q9Y572 518 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 VCLP18206 1134 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 EPHB1P54762 984 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CCNIQ14094 377 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RALGPS1Q5JS13 557 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 NAT14Q8WUY8 206 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 XYLT2Q9H1B5 865 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF302Q9NR11 478 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 FAM159BA6NKW6 160 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PDLIM1O00151 329 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ADCY3O60266 1144 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ZBED1O96006 694 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ETS2P15036 469 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MAGEA6P43360 314 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 AQP4P55087 323 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CNTN2Q02246 1040 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 FAM81AQ8TBF8 368 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 VWA5AO00534 786 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SIN3BO75182 1162 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PEX2P28328 305 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 L1CAMP32004 1257 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 IRX4P78413 519 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CAPSQ13938 189 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SURF1Q15526 300 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MMEL1Q495T6 779 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ACTRT2Q8TDY3 377 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF778Q96MU6 729 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RNF157Q96PX1 679 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CDH22Q9UJ99 828 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CREB3O43889 395 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PROCP04070 461 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RBL1P28749 1068 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 GABRB2P47870 512 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RPL26P61254 145 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 BTKQ06187 659 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MTMR2Q13614 643 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MBLAC2Q68D91 279 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PLD5Q8N7P1 536 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 MCUQ8NE86 351 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 PDE5AO76074 875 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 RAP1GAPP47736 663 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 SLC1A6P48664 564 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 DLG1Q12959 904 aa18.96■□□□□ 0.63
LRRC25-201ENST00000339007 KRT81Q14533 505 aa18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms