RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332345.10

LIMS1-201, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-201ENST00000332345 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.68□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 SHISA7A6NL88 538 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 MDM4O15151 490 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 LTFP02788 710 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 GJA4P35212 333 aa14.67□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 LUZP1Q86V48 1076 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 ZNF677Q86XU0 584 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.67□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 DCLK3Q9C098 648 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.67□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.67□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.67□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 SLC12A8A0AV02 714 aa14.66□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 TEX33O43247 280 aa14.66□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.66□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 GREM1O60565 184 aa14.65□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 PTPN5P54829 565 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 GAD2Q05329 585 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 NR1I3Q14994 352 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.65□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 PLD4Q96BZ4 506 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 IER2Q9BTL4 223 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 SYNCQ9H7C4 482 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-201ENST00000332345 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.65□□□□□ -0.06
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LIMS1-201ENST00000332345 UBASH3AP57075 661 aa14.64□□□□□ -0.07
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LIMS1-201ENST00000332345 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-201ENST00000332345 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-201ENST00000332345 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-201ENST00000332345 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-201ENST00000332345 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-201ENST00000332345 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-201ENST00000332345 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-201ENST00000332345 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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