RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 BCAR1P56945 870 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ROR1Q01973 937 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 VSIG1Q86XK7 387 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 URGCPQ8TCY9 931 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D13Q9NVG8 400 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 DNAJB4Q9UDY4 337 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 FZD10Q9ULW2 581 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB8Q9UN66 801 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 DNM1LO00429 736 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ENPP3O14638 875 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K6O95382 1288 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TTC4O95801 387 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CAPN2P17655 700 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TYMPP19971 482 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 NR1D1P20393 614 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TGM2P21980 687 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 OR1G1P47890 313 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 NME3Q13232 169 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 MTFR1Q15390 333 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 BNIPLQ7Z465 357 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 LRRN4Q8WUT4 740 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.571e-12■□□□□ 11.1
ACTB-201ENST00000331789 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.61■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CEP350Q5VT06 3117 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 BRCA2P51587 3418 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 DCDC2CA8MYV0 355 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ZBED1O96006 694 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SKOR1P84550 965 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 BFSP2Q13515 415 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 MORF4L2Q15014 288 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TCTN1Q2MV58 587 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 HOOK3Q86VS8 718 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TET1Q8NFU7 2136 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ADAM32Q8TC27 787 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 C9orf72Q96LT7 481 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 DEFB118Q96PH6 123 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 STAP1Q9ULZ2 295 aa18.6■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ZNF487B1APH4 448 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CAPN9O14815 690 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 GAD2Q05329 585 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 DEUP1Q05D60 604 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD22Q5VYY1 191 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CPT1BQ92523 772 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 USP29Q9HBJ7 922 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SAYSD1Q9NPB0 183 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PIGVQ9NUD9 493 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TMEM161AQ9NX61 479 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SCN5AQ14524 2016 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 OR4Q2P0C623 313 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 GOT1P17174 413 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 AMPD1P23109 780 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 MAGEA4P43358 317 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SLCO1A2P46721 670 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 GATMP50440 423 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 PPARDQ03181 441 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 TMEM109Q9BVC6 243 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 KANSL3Q9P2N6 904 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 LTFP02788 710 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 STIP1P31948 543 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TSPY1Q01534 308 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 GBE1Q04446 702 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 EMC10Q5UCC4 262 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PCGF5Q86SE9 256 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 RELL1Q8IUW5 271 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 EDEM1Q92611 657 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TLCD1Q96CP7 247 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms