RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.74■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.74■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 BCAP29Q9UHQ4 241 aa24.74■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 FDFT1P37268 417 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 SERPINB8P50452 374 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 RAP1GDS1P52306 607 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 GEN1Q17RS7 908 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 EURLQ9NYK6 297 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 NDUFA13Q9P0J0 144 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 PAK5Q9P286 719 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 GIPC1O14908 333 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 RALBP11234 206 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 FAM156AQ8NDB6 213 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 DCCP43146 1447 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 SIN3BO75182 1162 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 IL1R2P27930 398 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 LPCAT2Q7L5N7 544 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 THAP11Q96EK4 314 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 HSPBAP1Q96EW2 488 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 COL20A1Q9P218 1284 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.73■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 FAM58BPP0C7Q3 252 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 SLC18A1P54219 525 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 LSAMPQ13449 338 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CYLDQ9NQC7 956 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 NOL3O60936 208 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 SEPT6Q14141 434 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 ASLP04424 464 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 GLRBP48167 497 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 PPM1JQ5JR12 505 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 PDSS2Q86YH6 399 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 NLRP4Q96MN2 994 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa24.72■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 PSAPP07602 524 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 BPGMP07738 259 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CSH1P0DML2 217 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CSH2P0DML3 217 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 PSMC3P17980 439 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 MYBPC3Q14896 1274 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CHSY1Q86X52 802 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 RSAD1Q9HA92 442 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 SNX13Q9Y5W8 968 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 LRCH4O75427 683 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 DGAT1O75907 488 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 APOEP02649 317 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CRABP2P29373 138 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 TCEAL1Q15170 157 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 C16orf87Q6PH81 154 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 KLHDC10Q6PID8 442 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 FAM160B2Q86V87 743 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 C10orf107Q8IVU9 208 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 APOL1O14791 398 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 STRNO43815 780 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 SPAG6O75602 509 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 GTF2A2P52657 109 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 COQ4Q9Y3A0 265 aa24.71■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 WDR27A2RRH5 827 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 MT-CO1P00395 513 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CCR3P51677 355 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 PTP4A2Q12974 167 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 CMPK2Q5EBM0 449 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 RELL1Q8IUW5 271 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 JADE3Q92613 823 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 POLIQ9UNA4 740 aa24.7■■□□□ 1.55
PACS2-201ENST00000325438 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.7■■□□□ 1.54
PACS2-201ENST00000325438 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.7■■□□□ 1.54
PACS2-201ENST00000325438 H3BSA7 217 aa24.7■■□□□ 1.54
PACS2-201ENST00000325438 ATP9BO43861 1147 aa24.7■■□□□ 1.54
PACS2-201ENST00000325438 NOVP48745 357 aa24.7■■□□□ 1.54
PACS2-201ENST00000325438 TBCCQ15814 346 aa24.7■■□□□ 1.54
PACS2-201ENST00000325438 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PACS2-201ENST00000325438 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms