RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 GREM1O60565 184 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 SOX9P48436 509 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 NOMO3P69849 1222 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 FIGNQ5HY92 759 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 RBSNQ9H1K0 784 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 MYO6Q9UM54 1294 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.03■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 F5P12259 2224 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 FYNP06241 537 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 IFNAR2P48551 515 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 PDGFRLQ15198 375 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 EML3Q32P44 896 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 SHDQ96IW2 340 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 NOX5Q96PH1 765 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.02■■□□□ 1.12
COX5B-201ENST00000258424 CACNA1HO95180 2353 aa22.02■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 E2F8A0AVK6 867 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 AP5Z1O43299 807 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 FERP16591 822 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 CD72P21854 359 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 STARD6P59095 220 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 PRKCQQ04759 706 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 RUNX3Q13761 415 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 TAF5Q15542 800 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 NAA35Q5VZE5 725 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.01■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 PRR23AA6NEV1 266 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SART1O43290 800 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 STC2O76061 302 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 DCNP07585 359 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 C2CD6Q53TS8 623 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 OLFML1Q6UWY5 402 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 BBS7Q8IWZ6 715 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 RNF139Q8WU17 664 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 CPA5Q8WXQ8 436 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 CHFRQ96EP1 664 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SYT11Q9BT88 431 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 NUP58Q9BVL2 599 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 A0A1W2PQJ5 194 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SLC12A8A0AV02 714 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 CBFA2T2O43439 604 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 GYPCP04921 128 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 HMBSP08397 361 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 ASIC2Q16515 512 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA1Q92805 767 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 ATP2A3Q93084 1043 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 AGPAT1Q99943 283 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 FOXQ1Q9C009 403 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SYNCQ9H7C4 482 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 ECT2Q9H8V3 914 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 ITIH6Q6UXX5 1313 aa21.99■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 CYP17A1P05093 508 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 TPM3P06753 285 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 NCAM1P13591 858 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 CTHP32929 405 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 GABRB2P47870 512 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 Q6ZNB5 142 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 HTR3DQ70Z44 454 aa21.98■■□□□ 1.11
COX5B-201ENST00000258424 ERICH1Q86X53 443 aa21.98■■□□□ 1.11
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