RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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HOXD11-201ENST00000249504 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
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HOXD11-201ENST00000249504 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.38■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.37■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.37■□□□□ 0.85
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HOXD11-201ENST00000249504 HECTD3Q5T447 861 aa20.36■□□□□ 0.85
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HOXD11-201ENST00000249504 NMUR1Q9HB89 426 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.36■□□□□ 0.85
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HOXD11-201ENST00000249504 MTA2O94776 668 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 RALAP11233 206 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 TNNT1P13805 278 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 HDCP19113 662 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 PGFP49763 221 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 TUBP50607 506 aa20.35■□□□□ 0.85
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HOXD11-201ENST00000249504 BEND5Q7L4P6 421 aa20.35■□□□□ 0.85
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HOXD11-201ENST00000249504 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.35■□□□□ 0.85
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HOXD11-201ENST00000249504 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 TLR5O60602 858 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 DAB1O75553 588 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 FYNP06241 537 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 PARM1Q6UWI2 310 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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