RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 SNF8Q96H20 258 aa9.94□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 CASD1Q96PB1 797 aa9.94□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 RNF157Q96PX1 679 aa9.94□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.94□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 PRR20AP86496 221 aa9.92□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 SCAPQ12770 1279 aa9.92□□□□□ -0.82
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APOBEC1-201ENST00000229304 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 RAB6CQ53S08 254 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 DCAF6Q58WW2 860 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 VSTM1Q6UX27 236 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.92□□□□□ -0.82
APOBEC1-201ENST00000229304 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.92□□□□□ -0.82
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