RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 UGT1A9O60656 530 aa22.95■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 VDRP11473 427 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 NBPF20Q3BBV1 942 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 CHST13Q8NET6 341 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 USP6NLQ92738 828 aa22.95■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.95■■□□□ 1.27
HTATSF1-201ENST00000218364 GPAMQ9HCL2 828 aa22.95■■□□□ 1.27
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HTATSF1-201ENST00000218364 BMPR2Q13873 1038 aa22.95■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 C4orf22Q6V702 233 aa22.95■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 ARCQ7LC44 396 aa22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.95■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.95■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 CACNA2D1P54289 1103 aa22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT81Q14533 505 aa22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF220Q5VTB9 566 aa22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.95■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC7A8Q9UHI5 535 aa22.95■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 CXorf38Q8TB03 319 aa22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 SIKE1Q9BRV8 207 aa22.94■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.94■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF534Q76KX8 674 aa22.93■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 EDNRBP24530 442 aa22.93■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 PIDD1Q9HB75 910 aa22.93■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.93■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.92■■□□□ 1.26
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HTATSF1-201ENST00000218364 B4GALT5O43286 388 aa22.92■■□□□ 1.26
HTATSF1-201ENST00000218364 ATICP31939 592 aa22.92■■□□□ 1.26
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