RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MgarpQ8VI64 283 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pomgnt1Q91X88 660 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Trem2Q99NH8 227 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PrccQ9EQC8 491 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1354E9Q5G9 310 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AmhP27106 555 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tex35Q14BK3 207 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ifnl2Q4VK74 193 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lig4Q8BTF7 911 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wdr98Q8VC42 657 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Htra3Q9D236 459 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ttc9bQ9D6E4 239 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gkap1Q9JMB0 366 aa24.08■■□□□ 1.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21962L7N280 338 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plxna1P70206 1894 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 IhhP97812 411 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Taf5Q8C092 801 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AA792892Q8C6S1 278 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MrgpreQ91ZB7 310 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mgrn1Q9D074 532 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spatc1lQ9D9W0 342 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Caln1Q9JJG7 219 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Piwil1Q9JMB7 862 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nfu1Q9QZ23 255 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col6a1Q04857 1025 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mylk3Q3UIZ8 795 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Papss1Q60967 624 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 WtipQ7TQJ8 398 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abraxas1Q8BPZ8 407 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ugt2b1Q8R084 529 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem59Q9QY73 323 aa24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr743L7N1Y2 311 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cyp2b9P12790 491 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pih1d3Q3KNI6 218 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stt3bQ3TDQ1 823 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 9130409I23RikQ3TS87 320 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rbm20Q3UQS8 1199 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gpatch2lQ6PE65 482 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Uts2bQ765I1 113 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr538Q7TRT5 310 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Phf8Q80TJ7 1023 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ItpkaQ8R071 459 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam49bQ921M7 324 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Serpinb6cW4VSP4 379 aa24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Veph1A1A535 833 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atp8b4A2ANX3 1194 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zc3h12bG3X9I7 835 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Eno1P17182 434 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PfkmP47857 780 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wdr5P61965 334 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gbp8Q2V6D6 525 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Itga1Q3V3R4 1179 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PostnQ62009 838 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atg7Q9D906 698 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn2r84D3YWE3 849 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 AlpiF8VPQ6 554 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf112Q0VAW7 879 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam107bQ3TGF2 131 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q3TQQ9 903 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zdhhc19Q810M5 347 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam163bQ8BUM6 167 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TfgQ9Z1A1 397 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Plin4O88492 1403 aa24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Card9A2AIV8 536 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BC049352E9Q2Z6 85 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ptpn9O35239 593 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nrp1P97333 923 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CpQ61147 1061 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 EfsQ64355 560 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zkscan3Q91VW9 553 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc13a3Q91Y63 600 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 NamptQ99KQ4 491 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Epm2aQ9WUA5 330 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tnni1Q9WUZ5 187 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Siah3B2RWG3 268 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rap1gds1E9Q912 607 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ppargc1aO70343 797 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GsrP47791 500 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 St3gal1P54751 337 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Msx3P70354 204 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 UrgcpQ5NCI0 926 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nlrp4eQ66X19 978 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Amz1Q8BVF9 502 aa24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arhgef33Q8BW86 850 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 66.8 ms