RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Psmd12Q9D8W5 456 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Scgb2b20Q9JI02 112 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tfr2Q9JKX3 798 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nek3Q9R0A5 511 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Abca14E9Q8F8 1683 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Umodl1Q5DID3 1319 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rap1gds1E9Q912 607 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Srp72F8VQC1 671 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Schip1P0DPB4 484 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp2d9P11714 504 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PtprcapQ64697 197 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prrg3Q6PAQ9 231 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmc3Q7TQ69 1130 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ttc39cQ8VE09 580 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CarfQ8VHI4 689 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tc2nQ91XT6 489 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pcdhb18Q91Y02 792 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stard13Q923Q2 1113 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MutyhQ99P21 515 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm29554A0A087WNW4 188 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Xpnpep3B7ZMP1 506 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 FanceB8JJD6 213 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 UncxO08934 530 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vcam1P29533 739 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccnd3P30282 292 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 WhammQ571B6 793 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AagabQ8R2R3 316 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Grin3bQ91ZU9 1003 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpatch1Q9DBM1 930 aa11.29□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccdc163A2AGD7 326 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gbp4A4UUI3 631 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trim12cD3Z3L3 497 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Csf1rP09581 977 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc38a5Q3U1J0 479 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem130Q6NXM3 419 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Camkk2Q8C078 588 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Agbl2Q8CDK2 862 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Etv3Q8R4Z4 513 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmprss4Q8VCA5 435 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Usp29Q9ES63 869 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sv2aQ9JIS5 742 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r19G5E8G4 854 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wee1P47810 646 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LtbrP50284 415 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nat9Q3UG98 241 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lag3Q61790 521 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bcl2l1Q64373 233 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zbtb33Q8BN78 671 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tada3Q8R0L9 432 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adgrf1Q8VEC3 908 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trim16Q99PP9 556 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Snx10Q9CWT3 201 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pard6bQ9JK83 371 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SufuQ9Z0P7 484 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm3755K7N743 167 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fgf15O35622 218 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp2f2P33267 491 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Casp4P70343 373 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ddx42Q810A7 929 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aste1Q8BIR2 672 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bpifb6Q8BU51 449 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ldlrap1Q8C142 308 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr697Q8VFM4 317 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr345Q8VGK4 311 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BsndQ8VIM4 307 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mettl16Q9CQG2 553 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gprc5dQ9JIL6 344 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trip4Q9QXN3 581 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Itga9B8JK39 1036 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tal1P22091 329 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gjb1P28230 283 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TubP50586 505 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp2c38P56655 490 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dmc1Q61880 340 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Glt8d2Q640P4 349 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TtpalQ9D3D0 343 aa11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm28961A0A087WPA5 222 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21858A0A087WQ24 222 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Anxa8O35640 327 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acsl1P41216 699 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zdhhc9P59268 364 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rmdn3Q3UJU9 470 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ttc9Q3V038 219 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sema5aQ62217 1077 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpt2Q8BGT5 522 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8CCC3 530 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CerkQ8K4Q7 531 aa11.27□□□□□ -0.6
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chst15Q91XQ5 561 aa11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.6 ms