RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Maats1Q8BRC6 783 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SheQ8BSD5 492 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TbceQ8CIV8 524 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Znf622Q91VY9 476 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gemin2Q9CQQ4 269 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rab13Q9DD03 202 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Casp6O08738 276 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Got1P05201 413 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gdf6P43028 454 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wee1P47810 646 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tmprss9P69525 1065 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tcerg1lQ3B807 590 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dnajc1Q61712 552 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nlrp4fQ66X05 959 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vtcn1Q7TSP5 283 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 ItchQ8C863 864 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pde10aQ8CA95 790 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MttpO08601 894 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ap3d1O54774 1199 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 SykP48025 629 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CamkmtQ3U2J5 323 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cage1Q5IR70 849 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sdf4Q61112 361 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Myo6Q64331 1265 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ints6Q6PCM2 883 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Naa15Q80UM3 865 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc2a12Q8BFW9 622 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hmbox1Q8BJA3 419 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fra10ac1Q8BP78 315 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tns4Q8BZ33 696 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zhx3Q8C0Q2 951 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slitrk6Q8C110 840 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fam161aQ8QZV6 448 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Znf426Q8R1D1 550 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q9CQM1 111 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mta2Q9R190 668 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 DexiQ9WUQ7 95 aa7.46□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dlg5E9Q9R9 1921 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cep85lA0A1W2P884 806 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zbed5B2RPU8 756 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pbx3O35317 434 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hoxc13P50207 328 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pgap2Q3TQR0 254 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd207Q8VBX4 331 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Senp2Q91ZX6 588 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Exo5Q9CXP9 373 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Grtp1Q9D3N8 359 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Stk11Q9WTK7 436 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfp40B1B1D3 796 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PlauP06869 433 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 LtkP08923 888 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Uri1Q3TLD5 531 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Runx3Q64131 409 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tdpoz3Q717B4 365 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Krtcap3Q8K177 240 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fam114a2Q8VE88 497 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Syt10Q9R0N4 523 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cyp2g1Q9WV19 494 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm14459A2BI73 179 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr742A2RTP5 311 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vmn2r17E9PYF5 849 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrrc23O35125 340 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nr3c1P06537 783 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Man1a1P45700 655 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cntn3Q07409 1028 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zbtb48Q1H9T6 681 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 CtrcQ3SYP2 268 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Olfr213Q7TS32 327 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fbxl4Q8BH70 621 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Afap1l1Q8BZI0 768 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bpifb2Q8C1E1 462 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdk17Q8K0D0 523 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cadm4Q8R464 388 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GcshQ91WK5 170 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ucn3Q924A4 164 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Klhl10Q9D5V2 608 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc22a17Q9D9E0 401 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bmp15Q9Z0L4 392 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mtmr7Q9Z2C9 660 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Myh2G3UW82 1942 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Znf711A2ANX9 761 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MutP16332 748 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rasa2P58069 847 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cep112Q5PR68 954 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tbx10Q810F8 385 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Vipas39Q8BGQ1 491 aa7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Yipf4Q8C407 246 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.7 ms