RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640077.1

MED17-223, Transcript of mediator complex subunit 17, human

TSL 5

Gene MED17, Length 2,210 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED17-223	ENST00000640077	FHL2	Q14192	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	FYB1	O15117	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	AHSG	P02765	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	GNAI2	P04899	355 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	GPT	P24298	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	AMPH	P49418	695 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	DDR1	Q08345	913 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	BICD1	Q96G01	975 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SMO	Q99835	787 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	NFAT5	O94916	1531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ABCC6	O95255	1503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	FOXN1	O15353	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SUN1	O94901	812 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	INHBC	P55103	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SNX1	Q13596	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077		Q6YL49	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	IP6K1	Q92551	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	CHUK	O15111	745 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SOAT2	O75908	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	PYGL	P06737	847 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	FDXR	P22570	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	AVPR1B	P47901	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	SOX8	P57073	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	GBX1	Q14549	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	LNX2	Q8N448	690 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MED17-223	ENST00000640077	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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