RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 CYP2C18P33260 490 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CBWD6Q4V339 395 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ATG4AQ8WYN0 398 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MTMR8Q96EF0 704 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PAFAH2Q99487 392 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 VAT1Q99536 393 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RIPK2O43353 540 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MSCO60682 206 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TSHRP16473 764 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KCNK10P57789 538 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PTK2BQ14289 1009 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MROH9Q5TGP6 573 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA20Q8TB22 786 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 VPS26AO75436 327 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RBP1P09455 135 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GLRA2P23416 452 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GRK2P25098 689 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CREMQ03060 361 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KDSRQ06136 332 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC153Q494R4 210 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ERP27Q96DN0 273 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TTC30AQ86WT1 665 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HEATR9A2RTY3 570 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MAPK1P28482 360 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA13P48723 471 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CNTN2Q02246 1040 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MED21Q13503 144 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TINF2Q9BSI4 451 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 VAV3Q9UKW4 847 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ASMTLO95671 621 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RHOCP08134 193 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MGAT5Q09328 741 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CPNE1Q99829 537 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 C2CD2Q9Y426 696 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 STX5Q13190 355 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 UCMAQ8WVF2 138 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC39Q96DD0 335 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CEP19Q96LK0 163 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RBBP8Q99708 897 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms