RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NCAM1P13591 858 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB33AQ14088 237 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ELF2Q15723 593 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 BOLA3Q53S33 107 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM62Q9BVG3 475 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RRN3Q9NYV6 651 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 FNIP2Q9P278 1114 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SCML2Q9UQR0 700 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM92AA1XBS5 289 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CTSAP10619 480 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN7P35236 360 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 BMPR1AP36894 532 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CETN2P41208 172 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD7Q6UXD7 560 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 STKLD1Q8NE28 680 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 TEKT4Q8WW24 435 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBPL8Q9BZF1 889 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRD1A4D1F6 860 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 M0QYT0 321 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RALAP11233 206 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ATF2P15336 505 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 KDELR1P24390 212 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB2P25686 324 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 TUFMP49411 452 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 USP46P62068 366 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ODF2Q5BJF6 829 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SCD5Q86SK9 330 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP295NLQ96MC4 621 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCC13Q9NSE7 274 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 COMMD8Q9NX08 183 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 ATF6P18850 670 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKN2BP42772 138 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 CREMQ03060 361 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 LLGL1Q15334 1064 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 TAZQ16635 292 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR152Q8TDT2 470 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 HSPH1Q92598 858 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 EDEM1Q92611 657 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 EPC1Q9H2F5 836 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01553A4QN01 128 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MDM4O15151 490 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC24AO95486 1093 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 RDXP35241 583 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ARSEP51690 589 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP2R5EQ16537 467 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TFDP3Q5H9I0 405 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MON1AQ86VX9 555 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD6Q8NC69 237 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT12Q99456 494 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 LZTS1Q9Y250 596 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 RWDD3Q9Y3V2 267 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 DYNC1I1O14576 645 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOXF2BP0C7M4 288 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 YWHAQP27348 245 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CTNNB1P35222 781 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PGFP49763 221 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 DEUP1Q05D60 604 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ERMARDQ5T6L9 678 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 BTBD8Q5XKL5 378 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PRELID2Q8N945 189 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A14Q8TBB6 771 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC1Q9BTT6 524 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 HEMGNQ9BXL5 484 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 NMUR1Q9HB89 426 aa25.94■■□□□ 1.74
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