RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TTC25Q96NG3 672 aa7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TBCBQ99426 244 aa7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 VTA1Q9NP79 307 aa7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ADAMTS20P59510 1910 aa7.06□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ASB14A6NK59 587 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PTGESO14684 152 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CALB1P05937 261 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KRT16P08779 473 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TPBGLP0DKB5 382 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PAFAH1B1P43034 410 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 LMAN1P49257 510 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CYP2J2P51589 502 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NAB1Q13506 487 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 RNF157Q96PX1 679 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MROH8Q9H579 483 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CASS4Q9NQ75 786 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC169A6NNP5 214 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 B4GALT5O43286 388 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 RAD21O60216 631 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CEP104O60308 925 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CDH16O75309 829 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MICAL2O94851 1124 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NFICP08651 508 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ACVR2AP27037 513 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CRHR1P34998 444 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SLC8A3P57103 927 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NCOA4Q13772 614 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 C4orf22Q6V702 233 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FAM167AQ96KS9 214 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KLC4Q9NSK0 619 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 TREX1Q9NSU2 369 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FLRT1Q9NZU1 646 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MAGEC1O60732 1142 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 STRADAQ7RTN6 431 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MAP10Q9P2G4 905 aa7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 A0A1W2PPM1 405 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ECEL1O95672 775 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MMP2P08253 660 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 LINC00271P0C7V0 271 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 DLATP10515 647 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 FAAP100Q0VG06 881 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 MSL1Q68DK7 614 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 BBOF1Q8ND07 529 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 C2orf40Q9H1Z8 148 aa7.04□□□□□ -1.28
PCAT5-201ENST00000626667 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms