RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 MTAPQ13126 283 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 C10orf120Q5SQS8 335 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SYNPOQ8N3V7 929 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 EXOC4Q96A65 974 aa26.15■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 BECN2A8MW95 431 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ADIGQ0VDE8 80 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 ARHGAP44Q17R89 818 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 PMF1Q6P1K2 205 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 BHLHA9Q7RTU4 235 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 HSFY1Q96LI6 401 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 FBXO4Q9UKT5 387 aa26.14■■□□□ 1.78
PMS1-220ENST00000618056 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa26.14■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 LAMTOR5O43504 91 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 CYP17A1P05093 508 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 MYL5Q02045 173 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA8FQ08AF8 430 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 HTR3DQ70Z44 454 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 P2RY13Q9BPV8 354 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FANCLQ9NW38 375 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 DNAJC12Q9UKB3 198 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 NUDT5Q9UKK9 219 aa26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 MED7O43513 233 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GREM1O60565 184 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 TYRO3Q06418 890 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 KCNMA1Q12791 1236 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 DHCR24Q15392 516 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FSTL4Q6MZW2 842 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 ZNF606Q8WXB4 792 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 WBP2Q969T9 261 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GABBR2O75899 941 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 IRF1P10914 325 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 DRD1P21728 446 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GNA15P30679 374 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 NBL1P41271 181 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GPD2P43304 727 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 RPL34P49207 117 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GALK1P51570 392 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 KRT31Q15323 416 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GAB4Q2WGN9 574 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 SPEM1Q8N4L4 309 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 TAB2Q9NYJ8 693 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 MDM4O15151 490 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 ADH1CP00326 375 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 SP9P0CG40 484 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 RGS7P49802 495 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 DAOAP59103 153 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 GAS6Q14393 721 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 RHBDF2Q6PJF5 856 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 CD101Q93033 1021 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 ACP6Q9NPH0 428 aa26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 USP8P40818 1118 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 COG7P83436 770 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 STK32AQ8WU08 396 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 IRGQQ8WZA9 623 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 PHOX2BQ99453 314 aa26.1■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 E7ENQ6 273 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 PROB1E7EW31 1015 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 THAP12O43422 761 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 LCP1P13796 627 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 OPRD1P41143 372 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 CCR3P51677 355 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 EFEMP1Q12805 493 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 NCAPHQ15003 741 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 Q6ZS52 159 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 MIB1Q86YT6 1006 aa26.09■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FAM186AA6NE01 2351 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 STC2O76061 302 aa26.08■■□□□ 1.77
PMS1-220ENST00000618056 FBXO21O94952 628 aa26.08■■□□□ 1.77
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