RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612467.1

PCDHGA3-202, Transcript of protocadherin gamma subfamily A, 3, humanhuman

TSL 2

Gene PCDHGA3, Length 2,712 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3-202ENST00000612467 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 BMPR2Q13873 1038 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 ERP27Q96DN0 273 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 NPHS2Q9NP85 383 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 CPA4Q9UI42 421 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 CHKBQ9Y259 395 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 TREHO43280 583 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZBED1O96006 694 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 CYP2C9P11712 490 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 BNIP1Q12981 228 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 SNCBQ16143 134 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 DGKDQ16760 1214 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 FAM131BQ86XD5 332 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 SLC2A14Q8TDB8 520 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.65□□□□□ -0.06
PCDHGA3-202ENST00000612467 APOL1O14791 398 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 BEST1O76090 585 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 AMPD1P23109 780 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 CYP2F1P24903 491 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 CRADDP78560 199 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 PTK7Q13308 1070 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 CCL14Q16627 93 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 PPM1NQ8N819 430 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 KLHL29Q96CT2 875 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 HESX1Q9UBX0 185 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.65□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 ATP6V1G2O95670 118 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 PYGBP11216 843 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 PHBP35232 272 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZBTB6Q15916 424 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 PDK4Q16654 411 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 LRRC6Q86X45 466 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 HTTP42858 3142 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 NDUFV1P49821 464 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 TMEM110Q86TL2 294 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZFP42Q96MM3 310 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 TBCBQ99426 244 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 MGRN1O60291 552 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 CBX6O95503 412 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 GOT1P17174 413 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 OLIG2Q13516 323 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 OSTM1Q86WC4 334 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 ZNF276Q8N554 614 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 TTC17Q96AE7 1141 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 MECRQ9BV79 373 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 NOD2Q9HC29 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 HAO1Q9UJM8 370 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 COL1A2P08123 1366 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 L1CAMP32004 1257 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 TFDP2Q14188 446 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 BANPQ8N9N5 519 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 ADAM32Q8TC27 787 aa14.63□□□□□ -0.07
PCDHGA3-202ENST00000612467 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms