RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 RFX6Q8HWS3 928 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SLCO2A1Q92959 643 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 MTRRQ9UBK8 725 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 USP3Q9Y6I4 520 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 TET1Q8NFU7 2136 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 GABBR2O75899 941 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ENDOD1O94919 500 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 URODP06132 367 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2F1P24903 491 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ARL4AP40617 200 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 GLUD2P49448 558 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 EPHB4P54760 987 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ARPP19P56211 112 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 VSNL1P62760 191 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 EFHC2Q5JST6 749 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 TPGS2Q68CL5 300 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 EMBQ6PCB8 327 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 FIBCD1Q8N539 461 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 BBOF1Q8ND07 529 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF139Q8WU17 664 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA17Q96L03 361 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM209Q96SK2 561 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PNKPQ96T60 521 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 NPY6RQ99463 290 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF670Q9BS34 389 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 HEMGNQ9BXL5 484 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 AMACRQ9UHK6 382 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 INSL6Q9Y581 213 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 M0QYT0 321 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC5A3P53794 718 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DRG2P55039 364 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 GPS2Q13227 327 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 MTA1Q13330 715 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SMTNL2Q2TAL5 461 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 AADACL2Q6P093 401 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 BBS12Q6ZW61 710 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF365Q70YC5 407 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 MON1AQ86VX9 555 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RAPGEF5Q92565 580 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5C3BQ969T7 300 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 PRO3102Q9H379 93 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 GDF3Q9NR23 364 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 SCML2Q9UQR0 700 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFV1P49821 464 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 CLCN6P51797 869 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 HDAC4P56524 1084 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC7A5Q01650 507 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 NNTQ13423 1086 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 TAZQ16635 292 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 HDXQ7Z353 690 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 HAUS1Q96CS2 278 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC114Q96M63 670 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 ERP44Q9BS26 406 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 DCLK3Q9C098 648 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 CHST7Q9NS84 486 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 YJEFN3A6XGL0 299 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 E7ENQ6 273 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BRJ5 948 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D4O60343 1298 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 OR4Q2P0C623 313 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-212ENST00000591041 ACRP10323 421 aa23.56■■□□□ 1.36
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