RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf71A6NGG8 1288 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 EBAG9O00559 213 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 B4GALT3O60512 393 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN1O60635 241 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 TCEA3O75764 348 aa26.61■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa26.61■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC4A11Q8NBS3 891 aa26.6■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 LOC730098B7Z3J9 87 aa26.59■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 SRLQ86TD4 932 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF280BQ86YH2 543 aa26.59■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 HPDLQ96IR7 371 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINB12Q96P63 405 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 PHACTR1Q9C0D0 580 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBP1Q9H171 429 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 RSAD1Q9HA92 442 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLRC2P26717 231 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC114Q96M63 670 aa26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-204ENST00000587718 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.57■■□□□ 1.84
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
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CAPNS1-204ENST00000587718 ITGAVP06756 1048 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 SRGAP2BP0DMP2 458 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
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