RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577198.5

KRT18P55-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KRT18P55, Length 1,950 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P55-201ENST00000577198 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PGBD4Q96DM1 585 aa22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ZNF670Q9BS34 389 aa22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 CDH9Q9ULB4 789 aa22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TLDC2A0PJX2 215 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 SMIM23A6NLE4 172 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 HHLA1C9JL84 531 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 MCF2LO15068 1137 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 INPPL1O15357 1258 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 DAB1O75553 588 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 FYNP06241 537 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 GAD2Q05329 585 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TUSC3Q13454 348 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ANKRD22Q5VYY1 191 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 STRADAQ7RTN6 431 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 HASPINQ8TF76 798 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 CPT1BQ92523 772 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 C9orf72Q96LT7 481 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.17■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 AP1G2O75843 785 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 CYP11A1P05108 521 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 SLCO1A2P46721 670 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TKTL1P51854 596 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 SLC8A3P57103 927 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 RAB41Q5JT25 222 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 P3H4Q92791 437 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 USP29Q9HBJ7 922 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 RGS18Q9NS28 235 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PTPRDP23468 1912 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ZNF487B1APH4 448 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 C9IYK1 514 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 M0QZQ0 153 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PPARDQ03181 441 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 LONRF1Q17RB8 773 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 NPY6RQ99463 290 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PKMYT1Q99640 499 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.16■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 RASGRF2O14827 1237 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ODC1P11926 461 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 MAGEA4P43358 317 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PPP2R2AP63151 447 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 DCAF6Q58WW2 860 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 FAM171BQ6P995 826 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.15■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 APOL1O14791 398 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TGM2P21980 687 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 CYP2F1P24903 491 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 SULT1E1P49888 294 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ROR1Q01973 937 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 MFSD5Q6N075 450 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 FAM131BQ86XD5 332 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TMEM209Q96SK2 561 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 USP3Q9Y6I4 520 aa22.14■■□□□ 1.14
KRT18P55-201ENST00000577198 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.14■■□□□ 1.13
KRT18P55-201ENST00000577198 E7ENQ6 273 aa22.14■■□□□ 1.13
KRT18P55-201ENST00000577198 MAP3K6O95382 1288 aa22.14■■□□□ 1.13
KRT18P55-201ENST00000577198 GNRH1P01148 92 aa22.14■■□□□ 1.13
KRT18P55-201ENST00000577198 SKIP12755 728 aa22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms