RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 CYLDQ9NQC7 956 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 CISHQ9NSE2 258 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 OSER1Q9NX31 292 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.09■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 MDM4O15151 490 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 RARGP13631 454 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 GBP1P32455 592 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 KIF11P52732 1056 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 ELF2Q15723 593 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 PLK5Q496M5 336 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 EMC10Q5UCC4 262 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 ISM2Q6H9L7 571 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 ANO7Q6IWH7 933 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM25Q86YD3 366 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 ARID3AQ99856 593 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 DEC1Q9P2X7 70 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 NAGPAQ9UK23 515 aa22.08■■□□□ 1.13
PPP4C-211ENST00000567642 CACNA1AO00555 2505 aa22.08■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 GDF9O60383 454 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TNFRSF4P43489 277 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CRY1Q16526 586 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CBWD6Q4V339 395 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 HTR3DQ70Z44 454 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TIGD1Q96MW7 591 aa22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TULP3O75386 442 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 ALDH1A2O94788 518 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 RHOBTB1O94844 696 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 RAD23BP54727 409 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 STIM1Q13586 685 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 EOGTQ5NDL2 527 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 NUDT18Q6ZVK8 323 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 A0A0A0MRY4 1105 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SGK1O00141 431 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SLC30A4O14863 429 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF806P0C7X5 589 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 RALAP11233 206 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 MPLP40238 635 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PLA2G4AP47712 749 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PSEN1P49768 467 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 LRRC63Q05C16 580 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA20Q8TB22 786 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 BBS2Q9BXC9 721 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SMOC1Q9H4F8 434 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CEP192Q8TEP8 1941 aa22.05■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 PSMA7O14818 248 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SLC8A3P57103 927 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 CREB5Q02930 508 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 SCD5Q86SK9 330 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 RASSF3Q86WH2 238 aa22.04■■□□□ 1.12
PPP4C-211ENST00000567642 MIB1Q86YT6 1006 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms