RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 WBP2Q969T9 261 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.02■□□□□ 0.8
PKD1-232ENST00000566905 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CHRNB1P11230 501 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 LRRC32Q14392 662 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CHFRQ96EP1 664 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 ST7Q9NRC1 585 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.01■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CYP17A1P05093 508 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 PLA2G5P39877 138 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 EFEMP1Q12805 493 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 NCAPHQ15003 741 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 KLHDC10Q6PID8 442 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 BBS7Q8IWZ6 715 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CHRDQ9H2X0 955 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CNGB3Q9NQW8 809 aa20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 YJEFN3A6XGL0 299 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 E7ENQ6 273 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 LAMTOR5O43504 91 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 GABBR2O75899 941 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 HMBSP08397 361 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 GPD2P43304 727 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 COPB1P53618 953 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 DAOAP59103 153 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 PTK2Q05397 1052 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 MTAPQ13126 283 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 DHCR24Q15392 516 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 DGKKQ5KSL6 1271 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 BHLHA9Q7RTU4 235 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 ZNF276Q8N554 614 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 EDEM1Q92611 657 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 HSFY1Q96LI6 401 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 P2RY13Q9BPV8 354 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 MIS12Q9H081 205 aa19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 PTMSP20962 102 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 KLK7P49862 253 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 GALK1P51570 392 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 TMEM196Q5HYL7 178 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 BSPRYQ5W0U4 402 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 FSTL4Q6MZW2 842 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 Q6ZS52 159 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CLEC4CQ8WTT0 213 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 RNF139Q8WU17 664 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CD101Q93033 1021 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 EXOC4Q96A65 974 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 MARCH2Q9P0N8 246 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 STRIP2Q9ULQ0 834 aa19.98■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 SYCE3A1L190 88 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 ADH1CP00326 375 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 EGFP01133 1207 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 UCHL3P15374 230 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 ZNF18P17022 549 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CLCN1P35523 988 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 CCINQ13939 588 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 LY6G5CQ5SRR4 150 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 RHBDF2Q6PJF5 856 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 HTR3DQ70Z44 454 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 SLC47A2Q86VL8 602 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 PASD1Q8IV76 773 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 FAM71AQ8IYT1 594 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 OTUB2Q96DC9 234 aa19.97■□□□□ 0.79
PKD1-232ENST00000566905 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms