RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561436.1

HERC1-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, human

TSL 4

Gene HERC1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC1-215	ENST00000561436	CREB3	O43889	395 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CFI	P05156	583 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	ITGAM	P11215	1152 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	IL1R1	P14778	569 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PROZ	P22891	400 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	NDUFV1	P49821	464 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CPT1A	P50416	773 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PRKAG1	P54619	331 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	INHBC	P55103	352 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	COL10A1	Q03692	680 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	ELF2	Q15723	593 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436		Q6YL49	198 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SNX27	Q96L92	541 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.37	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436		A0A0B4J269	797 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436		F5H697	171 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	EXOC5	O00471	708 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	NPHP1	O15259	732 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PLA2G6	O60733	806 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CDKL5	O76039	1030 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	RASAL1	O95294	804 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CD6	P30203	668 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	NPTX2	P47972	431 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	COPA	P53621	1224 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	LILRA4	P59901	499 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CXADR	P78310	365 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SCAP	Q12770	1279 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TUBB3	Q13509	450 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	E2F2	Q14209	437 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CRB1	P82279	1406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436		H7C4K7	107 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PIAS2	O75928	621 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	CHKA	P35790	457 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	MTHFS	P49914	203 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	FOXI1	Q12951	378 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.35	□□□□□ -1.71
HERC1-215	ENST00000561436	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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