RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556814.5

FCF1-208, Transcript of FCF1, rRNA-processing protein, human

TSL 4

Gene FCF1, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCF1-208	ENST00000556814	CES2	O00748	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	MGST3	O14880	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	GLP2R	O95838	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	VIP	P01282	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	CREB1	P16220	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	NTSR1	P30989	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	COL10A1	Q03692	680 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	RAB30	Q15771	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	NELL1	Q92832	810 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	AGPS	O00116	658 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	PROP1	O75360	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	JTB	O76095	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	NUDT3	O95989	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	AR	P10275	920 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ITPKB	P27987	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	DGKQ	P52824	942 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814		A0A087WV62	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SPRY2	O43597	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	WDR47	O94967	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	FGA	P02671	866 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	BMP5	P22003	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ADRA1D	P25100	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ICA1	Q05084	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ACOX1	Q15067	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	WDR24	Q96S15	920 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	HTR7	P34969	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCF1-208	ENST00000556814	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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