RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	ADORA2A	P29274	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CCT8	P50990	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PDE6C	P51160	858 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	FOXF2	Q12947	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CCNI	Q14094	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	REPS1	Q96D71	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	AOX1	Q06278	1338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SYT5	O00445	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NXPH3	O95157	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	FES	P07332	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	HGF	P14210	728 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SERPINF1	P36955	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PGD	P52209	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TFF2	Q03403	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GLG1	Q92896	1179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ACKR2	O00590	384 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM38	O00635	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TLR5	O60602	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	VNN1	O95497	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MST1	P26927	711 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SLC5A2	P31639	672 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	UQCRC1	P31930	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	BCAT1	P54687	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SOX10	P56693	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GPS1	Q13098	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ASNA1	O43681	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SNX2	O60749	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GLP2R	O95838	553 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ITGA5	P08648	1049 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	AR	P10275	920 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	EPHA3	P29320	983 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MTHFS	P49914	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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