RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308		A6NLC8	198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308		H0Y3Z8	333 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	LEFTY2	O00292	366 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SOAT2	O75908	522 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RASAL1	O95294	804 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA6	P08133	673 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	HK1	P19367	917 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPN3	P20807	821 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC5A2	P31639	672 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	CCR5	P51681	352 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	BCAT1	P54687	386 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	LOXL3	P58215	753 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	MC2R	Q01718	297 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PIGF	Q07326	219 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	GRM4	Q14833	912 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308		J3KTA2	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SUN1	O94901	812 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TK1	P04183	234 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKCB	P05771	671 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	MGAT1	P26572	445 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	LRPAP1	P30533	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA1L	P34931	641 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SCNN1G	P51170	649 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66	1e-26	■■■■■ 97.1
SNHG1-222	ENST00000545308	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308		Q8NA96	180 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	HTRA1	Q92743	480 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	COG8	Q96MW5	612 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	PNKP	Q96T60	521 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308		B4E171	279 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNHG1-222	ENST00000545308	AGPS	O00116	658 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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