RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf78A6NCI8 922 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM49BA6NDI0 452 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ARNTLO00327 626 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF10BO14763 440 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 COCHO43405 550 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC172P0C7W6 258 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SP9P0CG40 484 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ADH5P11766 374 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 RARGP13631 454 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT5P13647 590 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC130P13994 396 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CD72P21854 359 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNA4P22459 653 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXA6P31267 233 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 GBP1P32455 592 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT9P35527 623 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 GRIA2P42262 883 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 DPP6P42658 865 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF4P43489 277 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CDR1P51861 262 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 KIF11P52732 1056 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 STX17P56962 302 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 LMNB2Q03252 620 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ARID5AQ03989 594 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PTK2Q05397 1052 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CNGA2Q16280 664 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 MAN2A1Q16706 1144 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ANO4Q32M45 955 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 EML3Q32P44 896 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CBWD6Q4V339 395 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CBWD3Q5JTY5 395 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf220Q5T0J3 134 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 LONP2Q86WA8 852 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SCML4Q8N228 414 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf29Q8N999 325 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC4A11Q8NBS3 891 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 IRGQQ8WZA9 623 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PNKPQ96T60 521 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SMOQ99835 787 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCL3Q9H2J4 239 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CYLDQ9NQC7 956 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCC13Q9NSE7 274 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ANO10Q9NW15 660 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 GMIPQ9P107 970 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 DEC1Q9P2X7 70 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 COL4A3Q01955 1670 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 BPTFQ12830 3046 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PATJQ8NI35 1801 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 M0QYV0 167 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CAPN9O14815 690 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 IRAK2O43187 625 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 TIMM44O43615 452 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 LRP3O75074 770 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CAVIN2O95810 425 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 LATS1O95835 1130 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 OLFM2O95897 454 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PROS1P07225 676 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC2A3P11169 496 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 CHRNB1P11230 501 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 PMLP29590 882 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-215ENST00000544584 GJA4P35212 333 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms