RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 GBP5Q96PP8 586 aa14.78□□□□□ -0.04
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PRAME-214ENST00000543184 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.045e-24■□□□□ 10.9
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PRAME-214ENST00000543184 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.75□□□□□ -0.05
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PRAME-214ENST00000543184 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.75□□□□□ -0.05
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PRAME-214ENST00000543184 RPS6KA3P51812 740 aa14.75□□□□□ -0.05
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PRAME-214ENST00000543184 ACSS2Q9NR19 701 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-214ENST00000543184 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-214ENST00000543184 RLFQ13129 1914 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-214ENST00000543184 WDR81Q562E7 1941 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAME-214ENST00000543184 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-214ENST00000543184 CAPN14A8MX76 684 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-214ENST00000543184 ITM2AO43736 263 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAME-214ENST00000543184 DNAJC6O75061 913 aa14.74□□□□□ -0.05
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