RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.51□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 P4HA2O15460 535 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 STRNO43815 780 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DNAJC6O75061 913 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 LIG4P49917 911 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 USP46P62068 366 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DYNLT1P63172 113 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 GTF2BQ00403 316 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MORN1Q5T089 497 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MON1BQ7L1V2 547 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TLK2Q86UE8 772 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ZNF398Q8TD17 642 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NT5C1BQ96P26 610 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ZWILCHQ9H900 591 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SENP1Q9P0U3 644 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 HES2Q9Y543 173 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TMEM63AO94886 807 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 KRT1P04264 644 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ETV4P43268 484 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NCKAP1LP55160 1127 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 LSAMPQ13449 338 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MAMLD1Q13495 774 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 KRT39Q6A163 491 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SV2AQ7L0J3 742 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 RAB20Q9NX57 234 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SLC24A2Q9UI40 661 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PHF24Q9UPV7 400 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 STK24Q9Y6E0 443 aa9.5□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SGK1O00141 431 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CYB561D2O14569 222 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 LPXNO60711 386 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TOMM70O94826 608 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MMP3P08254 477 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 RAP1GDS1P52306 607 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PDE1BQ01064 536 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 FAAP100Q0VG06 881 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DLG1Q12959 904 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 HIF1AQ16665 826 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 GSTA3Q16772 222 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CENPUQ71F23 418 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NDE1Q9NXR1 346 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 GALNT8Q9NY28 637 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CAPN14A8MX76 684 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PSTPIP1O43586 416 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CREB3O43889 395 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 OPHN1O60890 802 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PGM3O95394 542 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ARL2P36404 184 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NSFP46459 744 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 VEGFBP49765 207 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 AQP4P55087 323 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 PLCB3Q01970 1234 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 KRT72Q14CN4 511 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 BBS9Q3SYG4 887 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 HIPK4Q8NE63 616 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NAT14Q8WUY8 206 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 CPT1BQ92523 772 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 ACAP3Q96P50 834 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 HAPLN3Q96S86 360 aa9.49□□□□□ -0.89
THBS3-211ENST00000541990 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms