RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SLC2A7Q6PXP3 512 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 USP6NLQ92738 828 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SKA1Q96BD8 255 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 NMUR2Q9GZQ4 415 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 GCNT4Q9P109 453 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 NEU2Q9Y3R4 380 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TELO2Q9Y4R8 837 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 ACTL7BQ9Y614 415 aa10.5□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 CTGFP29279 349 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 GK3PQ14409 553 aa10.5□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 FAM118BQ9BPY3 351 aa10.5□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 CHST7Q9NS84 486 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 CLDN3O15551 220 aa10.5□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 GCNT3O95395 438 aa10.5□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 ASPHQ12797 758 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 CYP1B1Q16678 543 aa10.5□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 LRRC71Q8N4P6 559 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 WHRNQ9P202 907 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 FOCADQ5VW36 1801 aa10.5□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 F8W8V4 182 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 H3BSA7 217 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 K7ENM7 598 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 KDSRQ06136 332 aa10.49□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 CATSPER3Q86XQ3 398 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 160.6
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TRPS1-211ENST00000520276 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 RRM1P23921 792 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 GHRHRQ02643 423 aa10.49□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 SEL1L2Q5TEA6 688 aa10.49□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF276Q8N554 614 aa10.49□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.49□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 K7ERI5 159 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 FCHO1O14526 889 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC6O75061 913 aa10.49□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TLR1Q15399 786 aa10.49□□□□□ -0.73
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TRPS1-211ENST00000520276 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa10.49□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 DENND3A2RUS2 1198 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 SLC26A4O43511 780 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 TYROBPO43914 113 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 AKAP3O75969 853 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 GAP43P17677 238 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 STAT1P42224 750 aa10.48□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 CASP4P49662 377 aa10.48□□□□□ -0.73
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