RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517144.1

RNU6-232P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 232, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-232P, Length 64 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-232P-201ENST00000517144 TMEM232C9JQI7 657 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 H3BNC9 293 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 KPNA5O15131 536 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 TSHRP16473 764 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 HTR7P34969 479 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CASP5P51878 434 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CFHR3Q02985 330 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF425Q6IV72 752 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF398Q8TD17 642 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 VPS50Q96JG6 964 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 FAM50BQ9Y247 325 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 A0A087WZ62 844 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 AREL1O15033 823 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 BCAR3O75815 825 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 TRIM27P14373 513 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ADRA1DP25100 572 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ARHGAP25P42331 645 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 DEUP1Q05D60 604 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 SLC2A7Q6PXP3 512 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 RNF152Q8N8N0 203 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 A0A1W2PPC4 97 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 KCNU1A8MYU2 1149 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 APAF1O14727 1248 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 TMEM225BP0DP42 221 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 FGFR2P21802 821 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ATICP31939 592 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 PRIM2P49643 509 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 GPC5P78333 572 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 KCNB1Q14721 858 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 AWAT1Q58HT5 328 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 VSTM1Q6UX27 236 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 CNGA4Q8IV77 575 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 LRRC46Q96FV0 321 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 DSCR3O14972 297 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 PMM2O15305 246 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 TP73O15350 636 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 KCNQ3O43525 872 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 RNF8O76064 485 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 WDR47O94967 919 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 MYL4P12829 197 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 STT3AP46977 705 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 MTAPQ13126 283 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 FHL3Q13643 280 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ACOX1Q15067 660 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 ETFDHQ16134 617 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 BEND5Q7L4P6 421 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 PJA1Q8NG27 643 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 DENND1AQ8TEH3 1009 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 KAZALD1Q96I82 304 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-232P-201ENST00000517144 E5RJQ4 531 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms