RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 STK4Q13043 487 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CBFBQ13951 182 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NFYCQ13952 458 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BECN1Q14457 450 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GALNTL6Q49A17 601 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DUSP28Q4G0W2 176 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 METTL24Q5JXM2 366 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LCE2CQ5TA81 110 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM132EQ6IEE7 984 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 C11orf88Q6PI97 169 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RRM2BQ7LG56 351 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PXKQ7Z7A4 578 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CREBRFQ8IUR6 639 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CFAP52Q8N1V2 620 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL36Q8N4N3 616 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTC39CQ8N584 583 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMIEQ8NEW7 156 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TNIP2Q8NFZ5 429 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 METTL6Q8TCB7 284 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SCFD2Q8WU76 684 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NELL1Q92832 810 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF653Q96CK0 615 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAR2Q96K12 515 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PNKPQ96T60 521 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EYA3Q99504 573 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TCF25Q9BQ70 676 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EDEM3Q9BZQ6 932 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EHD2Q9NZN4 543 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 AGAP1Q9UPQ3 857 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF711Q9Y462 761 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PSAT1Q9Y617 370 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTC36A6NLP5 189 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BIN1O00499 593 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PSMA7O14818 248 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEC14L2O76054 403 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BEST1O76090 585 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CSPG5O95196 566 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CER1O95813 267 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 WNT11O96014 354 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATF2P15336 505 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF28P17035 718 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GNAT2P19087 354 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SAT1P21673 171 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NFKBIAP25963 317 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MC3RP41968 323 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTTG1IPP53801 180 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDH15P55291 814 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NLRP5P59047 1200 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LILRA4P59901 499 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRMPQ12912 555 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MYO1EQ12965 1108 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTP4A2Q12974 167 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RTP5Q14D33 572 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF792Q3KQV3 632 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TAPT1Q6NXT6 567 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SARM1Q6SZW1 724 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 STK32CQ86UX6 486 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 WFDC3Q8IUB2 231 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms