RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT81Q14533 505 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZDHHC24Q6UX98 284 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFX8Q6ZV50 586 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM199Q8N511 208 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF479Q96JC4 524 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NT5C1BQ96P26 610 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM5Q9C035 493 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUAK2Q9H093 628 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 DECR2Q9NUI1 292 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 IP6K2Q9UHH9 426 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 COG5Q9UP83 839 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 H7C4K7 107 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFB8O95169 186 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLAUP00749 431 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PF4V1P10720 104 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD19P15391 556 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NCLP19338 710 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARFIP2P53365 341 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEUP1Q05D60 604 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK3Q13188 491 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM57BQ71RH2 274 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPSB4Q96A44 273 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHMP4CQ96CF2 233 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS50Q96JG6 964 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERVV-2B6SEH9 535 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 MARCH6O60337 910 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP12O75317 370 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIAS2O75928 621 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 YY1P25490 414 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCM5P33992 734 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 DENND1CQ8IV53 801 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PIGKQ92643 395 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMLNQ96KR4 655 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TM2D2Q9BX73 214 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 EVPLQ92817 2033 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 F8W810 466 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBXN7O94888 489 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLA2G2AP14555 144 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADRA1DP25100 572 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC7A1P30825 629 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGGT1BP53609 377 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPC5P78333 572 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST3GAL2Q16842 350 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 P3H2Q8IVL5 708 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHPFQ8IZ52 775 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR56A3Q8NH54 315 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP2A3Q93084 1043 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCRL5Q96RD9 977 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 MEIS3Q99687 375 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 STK31Q9BXU1 1019 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPH1Q9BZG8 443 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFITM10A6NMD0 228 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms