RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513440.5

CLOCK-211, Transcript of clock circadian regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLOCK, Length 3,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCK-211ENST00000513440 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 LMO2P25791 158 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 MROH9Q5TGP6 573 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 USP29Q9HBJ7 922 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PPME1Q9Y570 386 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 MGAMO43451 1857 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 CYP2F1P24903 491 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PCK1P35558 622 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 GABRB2P47870 512 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 FAM131BQ86XD5 332 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PGLYRP2Q96PD5 576 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 MROH8Q9H579 483 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 HEY2Q9UBP5 337 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.61□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 GABBR2O75899 941 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 METTL18O95568 372 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 KCNJ11Q14654 390 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TAZQ16635 292 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ASRGL1Q7L266 308 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 A6NJR5 290 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 CYB561D2O14569 222 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 COPEO14579 308 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 DCTN3O75935 186 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 AMPD1P23109 780 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 CPA2P48052 419 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 HDAC4P56524 1084 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SLC6A3Q01959 620 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 RFX8Q6ZV50 586 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 MZB1Q8WU39 189 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ARMCX1Q9P291 453 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SIP14410 1827 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 E7ESA3 106 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 MAGEB2O15479 319 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ACVR2BQ13705 512 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 CCDC185Q8N715 623 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 KLC2Q9H0B6 622 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PAK5Q9P286 719 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 MCM8Q9UJA3 840 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.6□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 NDC80O14777 642 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SESN3P58005 492 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PPIL2Q13356 520 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 WDR90Q96KV7 1748 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 A0A1B0GUA9 196 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SERPINB3P29508 390 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 NAA25Q14CX7 972 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TTC7BQ86TV6 843 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 GJD2Q9UKL4 321 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 T-ENOLP0DO92 83 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ARFIP2P53365 341 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 WLSQ5T9L3 541 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TTC8Q8TAM2 541 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 TRIM55Q9BYV6 548 aa14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 SMPD1P17405 629 aa14.58□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 INCA1Q0VD86 236 aa14.58□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 BOLA3Q53S33 107 aa14.58□□□□□ -0.07
CLOCK-211ENST00000513440 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms